Главные Новости
Владимир Зеленский Техно Кино Автоновости
Ученые расшифровывают секреты ДНК самых жестких бобов в мире
Автор: Allnewsua.live

Ученые из Калифорнийского университета в Риверсайде расшифровали геном черноглазого гороха, что дает надежду питать растущее население Земли, особенно в связи с изменением климата.

Понимание генов, ответственных за засуху и жаростойкость гороха, в конечном итоге может помочь сделать другие культуры более жесткими.

Черноглазый горох - маленькие бобы с темными серединами. Они веками были основным продуктом питания в мире благодаря своей жесткости в отношении окружающей среды и исключительным питательным качествам, таким как высокое содержание белка и низкий уровень жира. В странах Африки к югу от Сахары они остаются источником белка номер один в рационе человека.

Геном - это полная коллекция генетических кодов, которые определяют такие характеристики, как цвет, рост и предрасположенность к болезням. Все геномы содержат очень повторяющиеся последовательности ДНК, которые профессор компьютерных наук UCR и со-лидер проекта Стефано Лонарди сравнивает с «сотнями тысяч одинаковых кусочков мозаики».

Лонарди описал процесс выяснения того, как последовательности мозаики сочетаются друг с другом, как «сложный в вычислительном отношении». Для этого команда Лонарди много раз собирала геном с помощью различных программных инструментов и параметров. Затем они создали новое программное обеспечение, способное объединить эти различные решения генома в единую, полную картину.



С успехом этого проекта горох с черными глазами присоединяется только к горстке других основных культур, чьи геномы были полностью секвенированы. Работа команды над проектом была опубликована в выпуске The Plant Journal, где она была представлена ​​в качестве обложки, а бесплатное программное обеспечение Lonardi можно загрузить через Интернет.

Исследования в области гороха с черными глазами, бобового, также известного как вигна, начались в Калифорнийском университете в Риверсайде более 40 лет назад. Но присутствие вигры в Риверсайде предшествует университету примерно на 200 лет.

«Вигвам поддерживает здесь людей с ранних колониальных времен», - сказал один из руководителей проекта Тимоти Клоуз, профессор ботаники и растительных наук UCR. «Хорошо, что мы привели это растение с такой большой местной историей в состояние, необходимое для научных исследований».

Это первый высококачественный эталонный геном вигны. Работа над ним началась три года назад, что стало возможным благодаря гранту в размере 0,6 млн. Долларов от Национального научного фонда или ННФ. Дополнительный грант в размере 000 NSF также поддержал вычислительные усилия.

Ключом к сложности проекта является размер исследовательской группы. В дополнение к Клоузу и Лонарди в команду вошли многие другие ученые UCR: Мария Муньос-Аматриан, Кихуа Лян, Стив Уонамейкер, Сассум Ло, Хинд Альхаками, Рашид Оунит, Филипп Робертс, Янсен Сантос, Арсенио Ндеве и Абид Мд. Хасан , Дополнительные члены команды в США прибыли из Калифорнийского университета в Дэвисе, Объединенного института генома Министерства энергетики в Калифорнии, Национального центра ресурсов генома в Нью-Мексико и Министерства сельского хозяйства США в Айове. Члены международной команды прибыли из Финляндии, Франции, Бразилии и Чехии.

Как и у людей, между отдельными вигвами есть различия. Знание того, какие гены отвечают за такие качества у людей, как цвет, размер или устойчивость к патогенам, поможет селекционерам разрабатывать новые сорта, еще лучше способные противостоять внешним вызовам.



«Наличие последовательности генома помогает ученым принимать решения о выборе родительских растений для скрещивания с целью получения желаемого потомства», - сказал Клоуз.

Одной из черт вигны, которую ученые сейчас пытаются понять, является ее замечательная способность восстанавливаться после стресса от засухи.

«Мы пытаемся выяснить, почему вигны настолько устойчивы к суровым условиям», - сказал Клоуз. «По мере того, как мы движемся в мир с меньшим количеством воды, доступной для сельского хозяйства, будет важно использовать эту способность и расширять ее, взяв на себя инициативу в виде вигны, чтобы направлять улучшения в других культурах, уязвимых к изменению климата».

Перекладено з EN: Technology Org.


Читать также: